Le Directeur peut déléguer certaines de ses tâches à des doyens regroupant une ou plusieurs disciplines.
| Décanat des Bois | flûte à bec, flûte traversière, hautbois, clarinette, basson, saxophone | Jörg Lingenberg |
| Décanat des Claviers | piano, orgue, clavecin, accordéon | Barbara Borse |
| Décanat des Cordes | violon, alto, violoncelle, contrebasse, guitare, harpe | Stefan Ruha |
| Décanat des Cuivres et Percussions | cor, cornet, trompette, trombone, tuba, euphonium, alto, basse, percussions | Pascal Emonet |
| Décanat du Chant | chant, chant choral | Jean-Luc Follonier |
| Décanat de la Danse | danse classique, danse contemporaine | Dorothée Franc |
| Décanat d'Expression Théâtrale | théâtre, atelier chorégraphique, diction, jeu verbal et divers ateliers | Anne Salamin |
| Décanat de l'Initiation musicale | rythmique Jaques-Dalcroze, méthode E. Willems | Anaïs Vouillamoz |
| Décanat du Langage musical | langage musical | Jean-Pierre Varone |
| Décanat de la Direction chorale et instrumentale | direction chorale, direction instrumentale | François-Xavier Delacoste |